قامت AFNCI من خلال وحدة ودجات التابعة لها بتنفيذ وتوفير بناء محطات المياه والكهرباء اللازمة لتشغيل معدات العلاج بالبروتونات والتي وصلت بالفعل للمستشفى . تم تخصيص مبنى منفصل داخل أرض المستشفى للعلاج بالبروتونات والذي من المقرر أن يفتح أبوابه لعلاج المرضى بحلول عام 2024 كأول مبنى من نوعه في مصر يقدم هذه الخدمة للأطفال والكبار على حد سواء.

وتعتبر استخدامات هذا النوع من العلاج أكثر ملاءمة للأورام الموضعية بما في ذلك أورام الجهاز العصبي المركزي. وتأتي درجة أمان هذا العلاج فى أنه يستهدف الأورام بدقة أكبر مع حماية الأعضاء المحيطة بها. وقدى أظهر العلاج بالبروتونات نتائج علاجية متقدمة حول العالم وسيتم اعتماد 57357 قريباً كأول مستشفى يستخدم هذا العلاج فى مصر .

كما أن من مزايا العلاج بالبروتونات أنه يقدم علاجًا إشعاعيًا آمنًا، خاصة في حالة الأطفال المصابين بالسرطان